เรือลำที่เกิดเหตุใช้ชื่อว่า อันดรีอันนา (Andrianna)[6] ออกเดินทางจากเมืองฏุบรุกในภูมิภาคไซเรเนอิกา ประเทศลิเบีย ทางใต้ของเกาะครีตในประเทศกรีซ เมื่อวันที่ 10 มิถุนายน 2023[6] เรือลำดังกล่าวบรรทุกผู้โดยสารจำนวนมากเกินกำหนด[7] ตามข้อมูลที่ได้จากอะลาร์มโฟน[8] องค์กรการกุศลสาธารณประโยชน์ด้านการค้นหาและกู้ภัยของยุโรปซึ่งอ้างว่าได้รับสัญญาณจากเรือลำดังกล่าว ระบุว่าเรือมีผู้โดยสารมากกว่า 750 คน อย่างไรก็ตาม ไม่เป็นที่แน่ชัดว่าจำนวนนี้มาจากเรือลำเดียวกับที่อับปางหรือไม่[9] ส่วนองค์การระหว่างประเทศเพื่อการย้ายถิ่น (ไอโอเอ็ม) ประมาณการผู้โดยสารบนเรืออยู่ที่ราว 400 คน โยอันนิส ซาฟีโรปูโลส (Ioannis Zafiropoulos) รองนายกเทศมนตรีนครกาลามาตา เมืองท่าของกรีซในหน่วยภูมิภาคเมซีนีอา ระบุว่าบนเรือมีผู้โดยสารกว่า 500 คน[10] เรือลำดังกล่าวเป็นเรือประมง[11] และประมาณกันว่ามีความยาว 20–30 เมตร[12] เรือลำนี้มีจุดหมายปลายทางอยู่ที่อิตาลี[13]

เมื่อวันที่ 13 มิถุนายน กองกำลังรักษาการณ์ชายฝั่งอิตาลีแจ้งเตือนทางการกรีซและฟรงแต็กซ์ (หน่วยงานป้องกันพรมแดนของสหภาพยุโรป) ว่ามีเรือกำลังมุ่งหน้าเข้ามา และเรือดังกล่าวกำลังอยู่ในภาวะคับขัน[9][8] โดยเฉพาะอย่างยิ่งทางการอิตาลีแจ้งให้กรีซทราบว่าเรือลำนั้นเคลื่อนที่อย่างผิดปกติ[14] กองกำลังรักษาการณ์ชายฝั่งของกรีซอ้างว่าหลังจากนั้น อากาศยานของฟรงแต็กซ์และเรือสินค้าสองลำ ตรวจพบว่าเรือลำดังกล่าวกำลังมุ่งหน้าขึ้นเหนือด้วยความเร็วสูง ทางการกรีซจึงส่งเรือออกไปเพิ่มเติม เจ้าหน้าที่กรีซอ้างว่าได้พยายามเสนอความช่วยเหลือแก่เรือลำดังกล่าว แต่ถูกปฏิเสธ[15]

ในช่วงบ่าย เรือสินค้าลำหนึ่งมุ่งหน้าเข้าหาเรืออันดรีอันนาและเสนอความช่วยเหลือ แต่ผู้โดยสารของอันดรีอันนาปฏิเสธ หลังจากนั้น เรือสินค้าอีกลำได้เสนอความช่วยเหลือเช่นกัน และก็ถูกปฏิเสธอีกเช่นกัน เรือรักษาการณ์ชายฝั่งของกรีซเข้าใกล้เรือลำดังกล่าวในช่วงเย็น และยืนยันว่าบนเรือมีผู้อพยพจำนวนมาก[9] ผู้อพยพบนเรือปฏิเสธไม่รับความช่วยเหลือใด ๆ และระบุว่าพวกตนประสงค์จะเดินทางต่อไปยังอิตาลี ในการเข้าหาเรือทั้งสามครั้ง ผู้อพยพบนเรือระบุว่าพวกตนต้องการอาหารและน้ำซึ่งเรือรักษาการณ์ของกรีซและเรือสินค้าติดธงมอลตาได้จัดหาให้[8]

เมื่อเวลาราว 01:40 น. (เวลาออมแสงยุโรปตะวันออก) ของวันที่ 14 มิถุนายน กองกำลังรักษาการณ์ชายฝั่งของกรีซได้รับแจ้งว่าเครื่องยนต์ของเรืออันดรีอันนาพัง[9] และขอความช่วยเหลือ ทางการกรีซจึงมุ่งหน้าเข้าเรือลำดังกล่าว และรายงานว่าได้ "เห็นเรือเลี้ยวขวา แล้วก็เลี้ยวซ้ายหักศอก ก่อนที่จะเลี้ยวขวาอีกครั้งอย่างแรงมากจนทำให้เรือพลิกคว่ำ" ราว 10–15 นาทีต่อมา เรืออันดรีอันนาได้อับปางลง ผู้โดยสารตกน้ำและลอยไปตามคลื่นในทะเลไอโอเนียน[14] เรืออับปางที่ตำแหน่งห่างจากชายฝั่งเมืองปีโลสในแคว้นเพโลพอนนีสไปประมาณ 50 ไมล์ (80 กิโลเมตร)[7] ตรงจุดที่เรืออับปาง พื้นทะเลมีความลึกราว 4,000 ถึง 5,200 เมตร[13][14] รายงานของกองกำลังรักษาการณ์ชายฝั่งกรีซระบุว่าบนเรือไม่มีใครสวมเสื้อชูชีพเลย[7]